Il faudrait un peu de contexte et pourquoi faire compliquer..le temps de présence, cela fait un peu entreprise, et heures payées. Ici je crois qu'on enregistre simplement s'ils sont là. Dans le texte en néerlandais, il n'y a pas de "automatique" ni "temps de présence".

B.D : tenue des registres obligatoires - [ Translate this page ]
le registre matricule ; (devenu "registre des élèves inscrits"). le registre d'appel ou de présence ;. le registre d'inventaire du mobilier de l'école et du ...
www.ac-nancy-metz.fr/ia57/ia/extria57/.../bd1_registre.htm - Cached

Statut de l'élève-stagiaire - Service public fédéral Emploi ... - [ Translate this page ]
L'élève-stagiaire doit être inscrit dans le registre du personnel de son .... de présence ou d'implication d'élèves-stagiaires lorsqu'ils sont occupés aux ...
www.emploi.belgique.be › ... › Jeunes travailleurs - Cached - Similar

ca a relation avec le systeme de presence aux ecoles

On dit en français "prendre les présences". "prise de présence" ne me semble pas correct (ça rappelle vaguement la "prise de température, ou la prise de sang"). Je dirais plutôt "relevé des présences".
Les présences sont portées sur une "liste de présence", qui pourrait aussi convenir ici, en fonction du contexte.

Dans votre suggestion de "système d'enregistrement automatique du temps de présence..." il me semble qu'il y a là beaucoup d'éléments qui ne sont pas dans l'original.
Rien n'indique qu'il s'agisse d'un "système", ni que celui-ci serait automatique.

Et le "temps de présence" suggère un calcul journalier, hebdomadaire, mensuel, etc..., des heures de présence, alors que prendre les présences est l'acte ponctuel de vérifier si tout le monde est là.

pas besoin de rajouter "enfants"